Züge in andere Bundesstaaten fahren vom Amtrak-Bahnhofsgebäude ab, dem zentralen Knotenpunkt auf der Westküstenstrecke, und von dem westlich gelegenen Bahnhofsgebäude, das an der Bahnstrecke liegt, die von den Rocky Mountains nach Salt Lake City in Utah und darüber hinaus verläuft. Es gibt täglich Züge nach Sacramento, San Joaquin Valley, Portland, Seattle, Vancouver, Reno, Salt Lake City, Denver, Chicago, San Jose, Los Angeles, Anaheim und San Diego. Einige Fahrzeitenbeispiele: Nach Los Angeles: zwischen 8 Std. 30 Minuten und 12 Std.; nach San Diego: 12 Std.; nach Ontario: 10 Std.; nach Las Vegas: 12 Std.

Es gibt Linienbusse zum Fährhafen in San Francisco und zu anderen Innenstadtzielen.

Die amerikanische Eisenbahnen stehen unter der Leitung von Amtrak (Tel: (800) 872 72 45. Internet: www.amtrak.com) und bieten normalerweise einen sehr guten Service an. Das Amtrak-Bahnhofsgebäude (Tel: (510) 450 10 81) liegt auf der anderen Seite der Bucht in Emeryville (nahe Oakland), in einer Abzweigung der Powell Street. Der Fahrkartenverkauf und die Gepäckabgabe befinden sich allerdings in Downtown im Fährgebäude am Ende der Market Street. Auf dem angeschlossenen, unbewachten Parkplatz kann man kostenlos parken. Es gibt außerdem eine Espresso-Bar, einen Zeitungsstand und einen Imbiss.